本学科1956年由著名神经外科学专家涂通今教授建立，是新中国最早创建的神经外科之一。1981年成为硕士学位授权学科，1986年被批准为博士学位授权学科，1995年成为临床医学博士后流动站组成学科，1996年成为国家“211工程”重点建设学科，1998年成为国家药物临床试验机构组成专业，1999年被评为“长江学者奖励计划”特聘教授岗位学科，同年被总后勤部批准为全军唯一的神经外科研究所，次年被总后勤部评为全军医学研究所“重中之重”建设学科。2002年被国家教育部评为国家重点学科，与北京天坛医院、上海华山医院神经外科同时成为中国神经外科学界的突出代表。2003年成为国家临床药理基地神经药物试验中心。2010年成为危重病医学全军重点实验室组成单位。2006年伊始迁入新病房大楼后，学科建设又迈上了新的台阶。经国家新闻出版总署和解放军总政治部宣传局批准，《中华神经外科疾病研究杂志》2001年在该学科创刊，并以质量取胜，于2003年入选国家科技论文统计源期刊（国家核心期刊），该杂志为双月刊，面向国、内外公开发行。
